为了确保理想的别离作用，要坚持卧螺离心机自身的平衡。要精准地平衡离心管和它们的内容物。事实上，超速离心机转子是镶置在一根很细的轴上，因此在两只离心管平衡时，重量之差不得逾越各种离心机阐明书上所规则的规模。

制备性超速离心机两离心管重量之差不得逾越0.1g。有套筒的离心管应带套筒一起平衡。离心管套筒不得在不同离心机之间混用。在抵达平衡条件之后，在添加物料的时分，也应当坚持平衡，以免离心力不对称损坏离心轴，形成严重事故。平衡好的离心管对称放好后盖好卧螺离心机盖，翻开电源，设置离心机转速和离心转速。

在快要抵达别离设定时刻的时分，应及时翻开减速或者是速度调理旋钮减速。待螺旋沉降离心机天然停止翻滚后，开盖取出离心管。封闭电源，拔掉电源插头。清洗卧螺离心机、离心室、离心管、套筒等。

卧螺离心机自身还设置有主动控制操作系统，设定离心速度、离心时刻、温度、真空度等参数后，翻开开关，设备将会主动工作。待抵达相关参数之后，记载时刻，抵达设定时刻之后螺旋沉降离心机主动停机，减速设备主动翻开。