许多控制系统都设置有清洗程序，在设备停机时启动清洗程序。以下步骤为一般清洗程序。

停机时，设备清洗程序如下：A.启动停机，离心机速度下降。B.升高差速度，较大限度的清楚固料。C.关闭离心机进料和任何进料辅助物/化学剂。D.开启冲洗阀，使冲洗水进入设备。E.达到300rpm（设备规格不同，速度不同）时，冲洗阀关闭，停止冲洗水进料。F.设备将缓缓停机，准备下次运行。

如果冲洗阀关闭时卸料液相仍然很脏，或设备下次启动时振动较强，可作相应调整，增加冲洗效率，具体方案如下：

增加冲洗液流量。

延长离心机减速的时间。

可能要求加入特殊清洗剂。

增加低转速冲洗时间。注意：在低转速时，产生的离心力较低，因此设备内暂存残留物的力也会降低。所以，低转速结合较大差转速的冲洗是较为有效的。